อิทาจิใช้เทคนิคเกนจุสึขั้นสูงสุด โคโตะ อามัตสึคามิ เพื่อปลดปล่อยตัวเองจากคาถาคืนชีพ จากนั้นอิทาจิก็ร่วมมือกับนารูโตะและคิลเลอร์บีเพื่อต่อสู้กับนากาโตะซึ่งยังอยู่ภายใต้การควบคุมของคาบูโตะ