หลังจากการโจมตีของเพน นินจาใบไม้ก็เริ่มสร้างหมู่บ้านขึ้นมาใหม่ นารูโตะและซากุระตื่นเต้นมากที่ได้กลับมาพบกับทาซึนะและอินาริหลานชายของเขาจากดินแดนแห่งคลื่นซึ่งมาช่วยเหลือ ในขณะที่การบูรณะดำเนินไป นินจาใบไม้และเพื่อนๆ ของพวกเขาได้ไตร่ตรองถึงเหตุการณ์ในอดีตที่มีอิทธิพลต่อหมู่บ้าน และช่วยให้ได้พันธมิตรอย่างเดอะแซนด์
นอกจากนี้เรายังได้ย้อนกลับไปสู่การเดินทางฝึกฝนของนารูโตะกับจิไรยะ และเข้าร่วมทีม 7 ดั้งเดิมในภารกิจเมื่อซาสึเกะยังอยู่กับพวกเขา!