นารูโตะได้พบกับชายชราคนงานก่อสร้างชื่อเกนโน อย่างไรก็ตาม เมื่อเกนโนขโมยแบบแปลนของอาคารบางแห่งในโคโนฮะ จู่ๆ นารูโตะก็พบว่าตัวเองตกอยู่ภายใต้การสอบสวนของหน่วย ANBU ความจริงเบื้องหลัง Gennou คืออะไร และเหตุใดจึงไม่มีใครรู้ว่าเกิดอะไรขึ้น