หลังจากผ่านไป 2 ปีครึ่ง ในที่สุดนารูโตะก็กลับมายังหมู่บ้านโคโนฮะของเขา และตั้งใจที่จะสานต่อความทะเยอทะยานของเขา มันจะไม่ง่ายเลยเพราะเขาได้รวบรวมศัตรูที่อันตรายอีกสองสามตัว เหมือนกับองค์กรชิโนบิ แสงอุษา.